Esta es la aplicación de Linux llamada VCF Explorer para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como VCFExplorer.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada VCF Explorer para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
Ad
VCF Explorer para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
Las tecnologías de alto rendimiento de costo decreciente llevaron a una serie de proyectos de secuenciación que consistían en miles de genomas completos. El cambio de paradigma del exoma al genoma completo trae un aumento significativo en el tamaño de los archivos de salida. La mayoría de las herramientas existentes que se desarrollan para analizar archivos de exoma no son adecuadas para archivos VCF grandes producidos por estudios de genoma completo. En este trabajo presentamos VCF-Explorer, un software de análisis de variantes capaz de manejar archivos de gran tamaño. La gestión eficiente de la memoria del programa y la eliminación del paso de análisis previo permiten realizar el análisis en ordenadores ordinarios. VCF-Explorer presenta un entorno fácil de usar donde se pueden definir varios tipos de consultas para la anotación y las muestras. VCF-Explorer se puede ejecutar en diferentes entornos y plataformas computacionales que van desde una computadora portátil estándar hasta un servidor avanzado.Caracteristicas
- Un entorno fácil de usar
- Gestión eficiente de la memoria
- Procesamiento de archivos VCF de gran tamaño (genoma completo)
- Operable en una computadora personal con recursos computacionales limitados
Interfaz de usuario
Qt
Lenguaje de programación
C ++, C
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
