Esta es la aplicación de Windows llamada AutoDockParser cuya última versión se puede descargar como AutodockParser.exe. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada AutoDockParser con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
AutoDockParser
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DESCRIPCIÓN
AutoDock Suit es uno de los software más populares para realizar acoplamiento molecular y detección virtual. Este traje ofrece dos programas AutoDock y AutoDock Vina. AutoDock proporciona su salida como archivos de registro de acoplamiento (archivos DLG), mientras que la última salida está en formato pdbqt.
El procesamiento posterior de estos resultados ha sido durante mucho tiempo un trabajo manual y, por lo tanto, se diseñan varios protocolos y flujos de trabajo específicos para el usuario. El procesamiento manual de estos resultados para el posterior análisis de interacción ha seguido siendo una tarea que requiere mucho tiempo y aparentemente mundana. El procesamiento manual implica la dependencia de varios programas externos.
AutoDock Parser ofrece posprocesamiento automático de los resultados de acoplamiento obtenidos de AutoDock Suit. AutoDock Parser es una herramienta fácil de usar destinada a minimizar los esfuerzos en el procesamiento posterior de los resultados del acoplamiento. Permite al usuario crear complejos proteína-ligando a partir de los archivos DLG/PDBQT de entrada en un solo paso.
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/autodockparser/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
