Esta es la aplicación de Windows llamada CAMPARI cuya última versión se puede descargar como campari_v4_12202020.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada CAMPARI con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
CAMPARI
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DESCRIPCIÓN
Estamos orgullosos de presentar la versión 4 de CAMPARI. Manteniendo la filosofía introducida con V3 para acelerar (casi) todo con la ayuda de OpenMP (paralelismo de subprocesos), hemos agregado una serie de nuevos algoritmos de la literatura reciente, más notablemente un módulo completo que trata con pequeñas moléculas de química arbitraria para aplicaciones. en acoplamiento computacional y diseño de fármacos. Naturalmente, CAMPARI continúa brindando la implementación de referencia del paradigma del campo de fuerza ABSINTH y el modelo de solución implícita.
CAMPARI es un paquete conjunto para realizar y analizar simulaciones moleculares, en particular de sistemas de relevancia biológica. Se centra en una amplia disponibilidad de algoritmos para el muestreo (avanzado) y es capaz de combinar Monte Carlo y la dinámica molecular de forma fluida. CAMPARI ofrece al usuario un nivel muy alto de control sobre todas las funciones implementadas. Para obtener más información y características, consulte la página de inicio del proyecto en http://campari.sourceforge.net.
Caracteristicas
- Muestreo combinado de MC y MD, MD en espacio cartesiano o torsional / de cuerpo rígido
- Paralelización eficiente de OpenMP de todas las rutinas centrales de energía / fuerza
- Análisis o ejecución sobre la marcha como herramienta de análisis de trayectoria (también en paralelo)
- Muchas rutinas de análisis integradas (DSSP, mapas de contactos, funciones de correlación de pares, etc.)
- Soporte para varios agrupamientos estructurales y algoritmos relacionados junto con análisis del modelo de estado de Markov
- Instalación de análisis independiente para las instalaciones del modelo de estado de clustering / Markov
- Totalmente documentado (html) y además se envía con 16 tutoriales
- Muy alto nivel de control sobre casi todas las funciones compatibles
- Amplio soporte para técnicas de simulación de múltiples réplicas en paralelo, como el intercambio de réplicas en ejecución paralela híbrida MPI / OpenMP
- Compatibilidad con aplicaciones de cribado de moléculas pequeñas con parametrización parcialmente automática
- Soporte para muchos potenciales de sesgo (distancias, posiciones, torsiones, estructura secundaria, densidades espaciales, compartimentación, propiedades poliméricas)
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Lenguaje de programación
Fortran
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/campari/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
