Esta es la aplicación de Windows llamada ChIP-RNA-seqPRO para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea cuya última versión se puede descargar como cloudclientID.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ChIP-RNA-seqPRO para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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ChIP-RNA-seqPRO para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN
ChIP-RNA-seqPRO: una estrategia para identificar regiones de desregulación epigenética asociadas con sitios de edición de ARN y empalme de transcripciones aberrantes. Scripts de Python ejecutables empaquetados junto con bibliotecas de anotaciones personalizadas, entrada de datos de demostración y guía README.9/26: v1.1 Se actualizó MAIN_IV para depurar el error generado por los pandas de Python que ya no admiten 'subconjunto'.
Este código ya no se mantendrá / actualizará activamente aquí. Ahora se encuentra disponible un recurso basado en la nube para el análisis comparativo de conjuntos de datos epigenéticos, de variación de secuencia y de expresión. Visite Cloudomics, proyecto para recursos basados en la nube: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Caracteristicas
- Herramienta para el análisis comparativo de una amplia variedad de conjuntos de datos de muestras emparejadas de secuenciación epigenómica (ChIPseq, MBDseq, etc.) y basada en ARN
- Si utiliza esta herramienta o cualquiera de las bibliotecas de anotaciones, incluya la siguiente referencia: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. y H. Ho T. (2015). Estrategias bioinformáticas para identificar regiones de desregulación epigenética asociadas con el empalme de transcripciones aberrantes y la edición de ARN. En Actas de la Conferencia Internacional sobre Modelos, Métodos y Algoritmos de Bioinformática, páginas 163-170. DOI: 10.5220 / 0005248001630170
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Pitón
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
