Esta es la aplicación de Windows llamada DEBay para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como Results.rar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada DEBay para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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DEBay para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN
DEBay: Deconvolución del conjunto a través del enfoque de BayesDEBay estima la expresión génica específica del tipo celular mediante la deconvolución de datos cuantitativos de PCR de una población mixta. Será útil en experimentos donde la segregación de diferentes tipos de células en una muestra es ardua, pero se puede medir la proporción de diferentes tipos de células en la muestra. DEBay utiliza los datos de distribución de la población y los datos de qPCR para calcular la expresión relativa del gen diana en diferentes tipos de células de la muestra.
Instrucciones de instalación y manual de usuario de DEBay: https://sourceforge.net/projects/debay/files/UserManual.pdf
Conjunto de datos de prueba de muestra: https://sourceforge.net/projects/debay/files/Test_data/
Información de la cita: Vimalathithan Devaraj y Biplab Bose. DEBay: una herramienta computacional para la deconvolución de datos cuantitativos de PCR para la estimación de la expresión génica específica del tipo de célula en una población mixta. bioRxiv 2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.10.035642
Caracteristicas
- Desconvoluciona la expresión génica específica del tipo de célula a partir de datos de PCR cuantitativos
- Desconvoluciona los datos de expresión génica tanto dependientes como independientes del tiempo
- Utiliza el método bayesiano de estimación de parámetros
- Da las estadísticas de los parámetros estimados
Audiencia
Ciencia / Investigación, Educación, Ingeniería
Interfaz de usuario
El proyecto es un sistema de interfaz de usuario (UI)
Lenguaje de programación
Python
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/debay/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
