Esta es la aplicación de Windows llamada FamSeq cuya última versión se puede descargar como FamSeq1.0.2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FamSeq con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
FamSeq
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DESCRIPCIÓN
Todavía es un desafío llamar variantes raras. En los estudios de secuenciación basados en la familia, se debe utilizar la información de todos los miembros de la familia para identificar con mayor precisión nuevas mutaciones de la línea germinal. FamSeq cumple este propósito al proporcionar la probabilidad de que una persona lleve una variante dadas las medidas brutas de toda su familia. FamSeq admite mutaciones de novo y puede realizar llamadas de variantes en el cromosoma X.
Para adaptarse a las variaciones en la complejidad de los datos, FamSeq consta de tres implementaciones distintas del modelo genético mendeliano: el algoritmo de red bayesiana, el algoritmo de Elston-Stewart y el algoritmo de Monte Carlo en cadena de Markov. Para hacer que el software sea eficiente y aplicable a familias numerosas, paralelizamos el algoritmo de red bayesiana que hace frente a las genealogías con bucles de consanguinidad sin perder precisión de cálculo en una unidad de procesamiento de gráficos NVIDIA®.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/famseq/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.