Esta es la aplicación de Windows llamada Genome Microsatellite Analyzing Tool cuya última versión se puede descargar como gmatoV1.2Build20130106.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Herramienta de análisis de microsatélites Genome con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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Herramienta de análisis de microsatélites del genoma
DESCRIPCIÓN
La creciente disponibilidad de secuencias de genomas completos cada vez más grandes (> 1G) derrotó a las herramientas de análisis SSR actualmente existentes. La herramienta de análisis de microsatélites en todo el genoma (GMATo) es un programa novedoso y poderoso para una minería SSR más rápida en cualquier longitud y tamaño, y un análisis estadístico completo en el aspecto del genoma, especialmente diseñado para un genoma enorme basado en scripts de Perl. Solo se requiere un archivo de entrada que contiene secuencias de ADN en formato fasta sin procesar y los archivos de salida en formato tabular enumeran toda la información de los loci SSR y la distribución estadística en cuatro clasificaciones interesadas de biólogos. GMATo también tiene una interfaz de usuario fácil y gráfica escrita en Java y una interfaz de línea de comandos en Perl, ya sea ejecutándose en plataformas Windows, Linux y Mac, etc., con control de parámetros fácilmente personalizado para biólogos y bioinformáticos. El software GMATo es una mejor herramienta para la caracterización de SSR en un genoma enormecite este artículo: Wang X. et al, Bioinformation [2013, 9 (10): 541-544]
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/gmato/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
