Esta es la aplicación de Windows llamada MANTI cuya última versión se puede descargar como maize_summary.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MANTI con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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PASTOSO
DESCRIPCIÓN
MANTI es una solución integral de anotación y evaluación de terminales N. MANTI era (des)conocido anteriormente como muda.pl antes de v3.7, el proyecto pasó a llamarse MANTI.pl con v3.7 el 2019-06-24.
Reúne información de 4 (u opcionalmente 5) archivos de salida MaxQuant diferentes en un archivo maestro adecuado explícitamente para análisis de proteínas neo-terminales. El ancla central para la recopilación de datos es el archivo modifySpecificPeptides.txt: los datos adicionales se infieren de otros archivos de origen diferentes de la carpeta MaxQuant txt. Tal vez también sea útil para fines proteómicos normales, pero este script está muy optimizado para la identificación y validación de neo-terminales de proteínas. Una interfaz gráfica está disponible como Yoğurtlu_MANTI (un script Perl/Tk) + ejecutar. versiones de la aplicación para Win10 sin necesidad de tener Perl instalado localmente.
Para obtener una explicación muy detallada de los parámetros del script y la estrategia de evaluación, consulte los extensos archivos PDF del manual que acompañan a cada versión.
Caracteristicas
- Evaluación MaxQuant N-terminales
- Evaluación y validación de Protein-Termini
- (UniProt) anotación y ensamblaje de datos
- Integración de Limma, LOCALIZER, TargetP2.0 y TopFINDer
- Re-mapeo de Termini identificados para corregir Isoformas
- Muchas opciones de visualización con scripts R suministrados
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/manti/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
