Esta es la aplicación de Windows llamada Pipeline Builder para herramientas NGS cuya última versión se puede descargar como pipeline_builder_20150106-1044-build-baf32e1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Pipeline Builder para herramientas NGS con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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Pipeline Builder para herramientas NGS
DESCRIPCIÓN
El manejo de archivos de configuración de herramientas NGS es un verdadero desafío para los biólogos y biotecnólogos modernos. Para aumentar la productividad, la especificidad y mejorar el procesamiento de datos, esta herramienta proporciona una colección de comandos ya estructurados, lo que lleva al usuario a construir la canalización correcta para los datos que tiene que analizar.
Pipeline Builder es una herramienta de secuencias de comandos para administrar tuberías de análisis NGS complejas. Ayuda al usuario a componer comandos de herramientas NGS y a componer su propia canalización de análisis. Permite un análisis reproducible independiente de los datos creando un entorno protegido que separa los datos de los resultados a través de la exportación de variables. Viene como una herramienta de línea de comandos con menús de asistente y tutoriales paso a paso.
Pipeline Builder está escrito en Perl y es multiplataforma.
Caracteristicas
- Construcción de oleoductos NGS
- Llamada paralela de la herramienta NGS
- Almacenamiento de datos sin superposición ni redundancia
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pipelinebuilder/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
