Esta es la aplicación de Windows llamada Pontos cuya última versión se puede descargar como Pontos-3.0-src.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Pontos con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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Puntos
DESCRIPCIÓN
Pontos es un programa Java gráfico y fácil de usar para el cálculo de matrices de distancia (o similitud) sin corregir a partir de alineaciones de secuencias de ADN en formato PHYLIP. También crea alineaciones de "diferencia" de las regulares (y viceversa).
Puede manejar las lagunas y las ambigüedades de diferentes formas.
Los huecos pueden ser:
- todo usado;
- todos ignorados;
- ignorado solo al final de las secuencias, por pares;
- ignorado solo en los extremos, pero ahora globalmente (en efecto, recortando toda la alineación a las secuencias más lejanas de los extremos).
Las ambigüedades (cosas como R, Y, N, W, etc. en una secuencia de ADN) se pueden tratar como:
- considerar las ambigüedades como siempre diferentes;
- considerar la ambigüedad como parcialmente diferente (por ejemplo, R sería 0.5 diferente de A o G);
- ignorar las ambigüedades en cada comparación por pares;
- eliminar todas las columnas, globalmente, que muestren alguna ambigüedad.
Pontos fue escrito en Linux, pero debería ejecutarse en cualquier sistema donde funcione Java. Pontos tiene la licencia GPL versión 3.
Audiencia
Ciencia / Investigación, Usuarios finales / Escritorio
Interfaz de usuario
Swing de Java
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pontos/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
