Esta es la aplicación de Windows llamada selectseq para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea cuya última versión se puede descargar como selectseq_old_1.3.6. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada selectseq para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
selectseq para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN:
Una utilidad de línea de comandos para manipular secuencias biológicas desde un archivo FASTA o FASTQ. Puede, dada una lista de identificadores, obtener solo un subconjunto de las secuencias (o su complemento, es decir, secuencias que NO están en la lista). También puede obtener el número de secuencia N solamente. Los archivos de secuencias comprimidas son compatibles si zcat los puede leer.Caracteristicas
- recopilar solo algunas secuencias de un archivo FASTA o FASTQ grande
- obtener el número de secuencia N solamente, independientemente de la identificación
- modo complemento: devuelve todas las secuencias que NO están en la lista de ID
- modo de "coincidencia": elija qué parte (entre | caracteres) de la identificación debe coincidir
- nombres de secuencia provistos uno por línea en un archivo de texto (se usa la primera palabra en la línea, o lo que se le dé a la opción -k)
- los símbolos > y @ se ignoran si están presentes al principio de los ID en la lista (útil si se utilizan identificadores FASTA o FASTQ)
- si solo se necesita una secuencia, su ID se puede dar directamente a la opción -l (no se necesita un archivo)
- agregue un sufijo a las ID antes de buscar (útil cuando las ID provienen de proteínas que tienen _1 en la ID, pero los genes no)
- Se admiten archivos de base de datos de secuencia comprimida (-s)
- bastante modo, emite solo advertencias y errores importantes
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/selectseq/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.