Esta es la aplicación de Windows llamada YeastpRofile para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea cuya última versión se puede descargar como YeastpRofile_V.2.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada YeastpRofile para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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YeastpRofile para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN
YeastpRofile es una aplicación de formulario de Windows portátil, escrita en C#, para calcular el perfil de una variable genómica alrededor de los sitios de inicio de transcripción (TSS) y terminación (TTS) de ARNm de levadura. El perfil se obtiene calculando el coeficiente de correlación de Pearson (R) de todo el genoma entre los valores de las variables genómicas y los recuentos de TSS (o TTS) en el desplazamiento incremental de la cadena transcrita. Los datos de los recuentos de TSS y TTS utilizados para calcular los perfiles se tomaron del trabajo de Pelechano et al. (1). El archivo de entrada debe ser un archivo con formato BedGraph basado en la versión R64 de la secuencia del genoma de la levadura. El archivo de salida es una tabla de texto delimitada por tabuladores que informa valores R para los diversos cambios de coordenadas variables con respecto a TSS o TTS. También se informa R relacionado con cada hebra para verificar que se obtiene un perfil similar en las dos direcciones de transcripción.1) V. Pelechano, W. Wei, LM Steinmetz, Extensa heterogeneidad transcripcional revelada por perfiles de isoformas, Nature, 497 (2013) 127-13.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C#
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
