این دستور cluster3 است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
cluster3 - Eisen-clustering data microarray
خلاصه
خوشه 3 [-f نام فایل] [-l 0|1] [-u اسم شغل] [-g [0..9]] [-e [0..9]] [-m [msca]] [-k
عدد] [-s 0|1] [-x عدد] [-y عدد]
OPTIONS
-h--کمک نمایش خلاصه گزینه ها
-f نام فایل
بارگیری فایل
-u اسم شغل
به شما امکان می دهد نام دیگری برای فایل های خروجی تعیین کنید (پیش فرض مشتق شده است
از نام فایل ورودی)
-l 0 | 1 مشخص می‌کند که آیا داده‌ها تبدیل به لاگ تبدیل شوند (پیش‌فرض 0 است، بدون ثبت تبدیل)
-k عدد مشخص می کند که آیا به جای خوشه بندی سلسله مراتبی، خوشه بندی k-means اجرا شود،
و تعداد خوشه‌های k برای استفاده (پیش‌فرض: 0)
-x عدد بعد افقی شبکه SOM را مشخص می کند (پیش فرض: 2)
-y عدد بعد عمودی شبکه SOM را مشخص می کند (پیش فرض: 1)
-s 0 | 1 مشخص می کند که آیا به جای خوشه بندی سلسله مراتبی، SOM محاسبه شود
(به طور پیش فرض: 0)
-v - نسخه
نمایش نسخه برنامه
-g [0..9] اندازه گیری فاصله را برای خوشه بندی ژنی 0 مشخص می کند: خوشه بندی ژنی وجود ندارد 1:
همبستگی بدون مرکز 2: همبستگی پیرسون 3: همبستگی بدون مرکز، قدر مطلق 4:
همبستگی پیرسون، قدر مطلق 5: همبستگی رتبه اسپیرمن 6: تاو کندال 7:
فاصله اقلیدسی 8: فاصله اقلیدسی به طور هماهنگ جمع شده 9: فاصله بلوک شهر
(به طور پیش فرض: 1)
-e [0..9] اندازه گیری فاصله را برای خوشه بندی ریزآرایه 0 مشخص می کند: بدون خوشه 1:
همبستگی بدون مرکز 2: همبستگی پیرسون 3: همبستگی بدون مرکز، قدر مطلق 4:
همبستگی پیرسون، قدر مطلق 5: همبستگی رتبه اسپیرمن 6: تاو کندال 7:
فاصله اقلیدسی 8: فاصله اقلیدسی به طور هماهنگ جمع شده 9: فاصله بلوک شهر
(به طور پیش فرض: 0)
-m [msca] مشخص می کند که از کدام روش خوشه بندی سلسله مراتبی استفاده شود: به صورت زوجی کامل-
پیوند s: تک پیوندی جفتی ج: مرکز پیوندی جفتی a: میانگین زوجی
پیوند (پیش‌فرض: m)
از cluster3 به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
