این دستور cmtk-interleaved_bad_slices است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
interleaved_bad_slices - برش های بد را در یک سری زمانی از تصاویر در هم پیچیده پیدا کنید (به عنوان مثال، یک
سری fMRI در حالت استراحت).
خلاصه
interleaved_bad_slices ImagePaths
شرح
این ابزار یک سری زمانی از تصاویر سه بعدی را می خواند و نقاط پرت را تشخیص می دهد.
OPTIONS
جهانی ابزار گزینه (اینها هستند به اشتراک گذاشته شده by تمام CMTK ابزار)
--کمک
لیستی از گزینه های خط فرمان اصلی را در خروجی استاندارد بنویسید.
--کمک-همه
لیست کاملی از گزینه های خط فرمان اولیه و پیشرفته را در خروجی استاندارد بنویسید.
--ویکی
فهرستی از گزینه های خط فرمان را در خروجی استاندارد در نشانه گذاری مدیاویکی بنویسید.
--مرد
منبع صفحه مرد را در نشانه گذاری 'nroff' در خروجی استاندارد بنویسید.
- نسخه
نسخه جعبه ابزار را در خروجی استاندارد بنویسید.
-- پژواک
خط فرمان فعلی را در خروجی استاندارد بنویسید.
- سطح پرمخاطب
سطح پرحرفی را تنظیم کنید
-- پرحرف, -v
سطح پرحرفی را 1 افزایش دهید (منسوخ شده؛ برای سازگاری با عقب پشتیبانی می شود).
--موضوعات
حداکثر تعداد رشته های موازی (برای رشته های POSIX و OpenMP) را تنظیم کنید.
ورودی گزینه
- جهت برش
جهت برش تصاویر انتشار را تعریف کنید. مقادیر پشتیبانی شده: "محوری"،
"sagittal"، "coronal"، "slice-x"، "slice-y"، "slice-z"، که در آن پیش فرض "محوری" است،
یا از یکی از موارد زیر استفاده کنید:
-- محوری
برش های محوری [این is la پیش فرض]
-- ساژیتال
برش های ساژیتال
--تاج گل
برش های تاج
---slice-x
محور مختصات X جهت برش است
---slice-y
محور مختصات Y جهت برش است
---slice-z
محور مختصات Z جهت برش است [این is la پیش فرض]
بد تکه کشف
-- متریک
معیار تشابه تصویر به تصویر برای مقایسه برش های همسایه. مقادیر پشتیبانی شده:
"ncc"، "rms"، که در آن پیش فرض "ncc" است، یا از یکی از موارد زیر استفاده کنید:
--ncc
همبستگی متقابل نرمال شده [این is la پیش فرض]
--rms
ریشه میانگین اختلافات مجذور.
--stdev-thresh
آستانه برای شناسایی برش بد در واحدهای شدت انحراف استاندارد بیش از
تمام برش های مربوطه از تصاویر انتشار باقی مانده. [پیش‌فرض: 3]
تولید گزینه
--بد-برش-کوبیدن
حداقل تعداد برش های بد شناسایی شده قبل از گزارش یک حجم (فقط تعداد
برش های بد شناسایی شده در این مورد به جای هر برش جداگانه گزارش می شود).
[پیش‌فرض: 0]
AUTHORS
تورستن روهلفینگ، با مشارکت مایکل پی. هاسک، گرگ جفریس، کالوین آر.
مورر، دانیل بی. روساکوف، و یاروسلاو هالچنکو
از cmtk-interleaved_bad_slices به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
