این دستور coverageCount است که می‌تواند در ارائه‌دهنده میزبانی رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه‌ساز آنلاین ویندوز یا شبیه‌ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
coverageCount - شمارش پوشش خوانده شده های نقشه برداری شده در هر مکان در کل
ژنوم مرجع
شرح
coverageCount نسخه 1.5.0-p1
این برنامه پوشش خوانش های نقشه برداری شده را در هر مکان محاسبه می کند
ژنوم مرجع این یک فایل باینری برای هر کروموزوم با الحاق کروموزوم ایجاد می کند
سطوح پوشش به صورت اعداد صحیح 4 بایتی.
استفاده
coverageCount [گزینه ها] -i -o
استدلال های مورد نیاز:
-i
نام فایل ورودی با فرمت SAM یا BAM.
-o
پیشوند فایل های خروجی هر فایل خروجی شامل اعداد صحیح چهار بایتی است
استدلال های اختیاری:
--maxMOp حداکثر تعداد عملیات "M" مجاز در یک رشته CIGAR.
10 به صورت پیش فرض هر دو "X" و "=" به عنوان "M" و عملیات "M" مجاور در نظر گرفته می شوند
در رشته سیگار ادغام شد.
coverageCount نسخه 1.5.0-p1
این برنامه پوشش خوانش های نقشه برداری شده را در هر مکان محاسبه می کند
ژنوم مرجع این یک فایل باینری برای هر کروموزوم با الحاق کروموزوم ایجاد می کند
سطوح پوشش به صورت اعداد صحیح 4 بایتی.
استفاده
coverageCount [گزینه ها] -i -o
استدلال های مورد نیاز:
-i
نام فایل ورودی با فرمت SAM یا BAM.
-o
پیشوند فایل های خروجی هر فایل خروجی شامل اعداد صحیح چهار بایتی است
استدلال های اختیاری:
--maxMOp حداکثر تعداد عملیات "M" مجاز در یک رشته CIGAR.
10 به صورت پیش فرض هر دو "X" و "=" به عنوان "M" و عملیات "M" مجاور در نظر گرفته می شوند
در رشته سیگار ادغام شد.
با استفاده از خدمات onworks.net از coverageCount به صورت آنلاین استفاده کنید
