این دستور DBdust است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
DBdust - توضیحات
خلاصه
DBdust [-b] [-wINT(64)] [-tدو برابر (2.)] [-mINT(10)] path:db|سد
شرح
الگوریتم DUST متقارن را روی قرائت‌های موجود در DB حذف نشده اجرا می‌کند مسیر.db یا مسیر.سد
تولید آهنگ .مسیر.dust[.anno,.data] که تمام فواصل با پیچیدگی کم را مشخص می کند
ترتیب، جایی که پنجره اسکن اندازه است -w، آستانه برای کم پیچیدگی بودن
فاصله است -t، و فقط فواصل کامل اندازه بزرگتر از -m ثبت می شوند. اگر
-b گزینه تنظیم می شود سپس تعریف پیچیدگی کم فراوانی را در نظر می گیرد
یک پایگاه داده شده اگر یک DB داده شود که داده های جدیدی به آن اضافه شده باشد، دستور افزایشی است
از آنجایی که آخرین بار روی DB اجرا شد، پس از آن آهنگ را برای شامل خواندن های جدید گسترش می دهد.
تنظیم این پرچم برای ژنوم هایی با سوگیری قوی AT/GC بسیار مهم است، البته کد این است.
کمی کندتر مسیر گرد و غبار، در صورت وجود، قابل درک و استفاده است DBshow(1)
DBstats(1)، و دالینر(1).
DBdust همچنین می تواند روی یک بلوک DB تراشیده نشده اجرا شود که در این صورت یک آهنگ خروجی می دهد
رمزگذاری جایی که نام فایل ردیابی حاوی شماره بلوک است، به عنوان مثال .FOO.3.dust.anno و
.FOO.3.dust.data، به FOO.3 در خط فرمان داده شده است. ما به این می گوییم a مسدود کردن مسیر. این
اجازه موازی کاری در تکه های بلوک اندازه و دنباله ای از مسیرهای بلوک را می دهد.
سپس می توان با Catrack در یک آهنگ برای کل DB تریم نشده ادغام کرد.
از DBdust به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
