این دستور gmod_make_cvtermpath.plp است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gmod_make_cvtermpath.pl - بسته شدن گذرا را در شرایط هستی شناسی در
جدول cvterm
طریقه استفاده
perl gmod_make_cvtermpath.pl -H [dbhost] -D [dbname] [-vt] -c cvname
perl gmod_make_cvtermpath.pl -g [GMODConf_profile] -c cvname
پارامترهای
-c نام هستی شناسی (cv.name) برای محاسبه بسته شدن متعدی روی. (ضروری)
-v خروجی گویا
-t حالت آزمایشی. به هیچ وجه عملیات فروشگاهی را انجام ندهید. (اجرا نشده)
-o outfile برای خطاهای نوشتن و پیام های پرمخاطب (اختیاری)
-g نام نمایه پایگاه داده GMOD (می تواند نام میزبان و DB را ارائه دهد) پیش فرض: "پیش فرض"
If نه با استفاده از a GMOD پایگاه داده نمایه (گزینه -g) سپس شما باید ارائه la پیروی
پارامترهای
-D نام پایگاه داده
-H نام میزبان
-d نام درایور پایگاه داده (به عنوان مثال 'Pg' برای postgres)
-u [اختیاری- در صورت عدم استفاده از کاربر پیش فرض] نام کاربری پایگاه داده
-p [اختیاری- اگر برای اتصال به پایگاه داده خود به رمز عبور نیاز دارید] رمز عبور برای کاربر شما
برای اتصال به پایگاه داده
شرح
این اسکریپت بسته شدن متعدی را در شرایط هستی شناسی در جدول cvterm محاسبه می کند.
از آنجایی که این یک عملیات محاسباتی فشرده است، این کار را روی یک رزومه بزرگ مانند Gene انجام دهید
هستی شناسی می تواند چندین ساعت طول بکشد. برای اطلاعات بیشتر در مورد اینکه بسته شدن متعارف چیست،
مراجعه کنید به:
http://www.geneontology.org/GO.database.shtml#نمودارها
از gmod_make_cvtermpath.plp به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
