این دستور ipig است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
ipig - ادغام PSM ها در تجسم مرورگر ژنوم
خلاصه
ipig <psm فایل> |-g|-c|-cg [ ]
شرح
iPiG ادغام منطبقات طیف پپتیدی (PSMs) از طیف سنجی جرمی را هدف قرار می دهد.
شناسایی پپتید (MS) به تجسم ژنومی که توسط مرورگر ژنوم ارائه می‌شود
به عنوان مرورگر ژنوم UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG PSM ها را از فرمت استاندارد MS mzIdentML (*.mzid) یا در قالب متن و
نتایج را در فرمت‌های آهنگ ژنوم (فایل‌های BED و GFF3) ارائه می‌دهد که به راحتی قابل انجام است
وارد مرورگرهای ژنوم می شود.
OPTIONS
<psm فایل>
نشان می دهد فایل با طیف پپتیدی مطابقت دارد (mzid/txt)
-g, -gui
رابط کاربری گرافیکی iPiG را شروع می کند
-c, -کنترل
کنترل ژن را شروع می کند، فایل های لازم باید در پیکربندی نشان داده شوند
پرونده
-cg, -controlgui
رابط کاربری گرافیکی کنترل ژن را شروع می کند
-d, -دانلود کننده
راهنمای دانلود را شروع می کند
یک فایل پیکربندی متفاوت را می توان نشان داد (در غیر این صورت ipig.conf توسط بارگذاری می شود
پیش فرض)
الزامات اضافی:
با استفاده از حالت غیر رابط کاربری، یک فایل پیکربندی (به طور پیش فرض ipig.conf) باید حاوی چندین فایل باشد
پارامترهای اضافی، به عنوان مثال نشان دادن ژنوم مرجع و غیره.
در حالت gui (-g و -cg)، پارامترهای اضافی را می توان به دو صورت در داخل نشان داد
رابط یا با یک فایل پیکربندی نیز.
برای مثال ها و جزئیات بیشتر در مورد readme.txt و ipig.conf نگاهی بیندازید
پارامترهای اضافی
با استفاده از خدمات onworks.net از ipig آنلاین استفاده کنید
