این دستور kmc_tools است که می تواند در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
kmc_tools - عملیات اضافی در پایگاه داده های k-mer
خلاصه
kmc_tools [پارامترهای جهانی] [پارامترهای عملیات]
شرح
این دستور و کامنت های فرعی مختلف آن تعدادی عملیات را روی KMC اجرا می کند
پایگاه های داده
k-mers مجموعه عملیات برای 2 KMC پایگاه های داده
تلاقی کردن
تقاطع 2 k-mers مجموعه
kmers_comstract
تفریق 2 مجموعه k-mers
شمارنده_ تفریق
شمارنده تفریق 2 مجموعه k-mer
اتحادیه
اتحاد دو مجموعه k-mers
عملیات برای تنها کیلومتر پایگاه داده
نوع
k-mers را از پایگاه داده تولید شده توسط KMC2.x مرتب می کند
كاهش دادن
K-merهای خیلی نادر و خیلی مکرر را حذف کنید
جمع و جور
شمارنده ها را حذف کنید (فقط k-mers را ذخیره کنید)
هیستوگرام
هیستوگرام وقوع k-mers
موادی که موقتا برای استعمال انبار میشود
k-mers و شمارنده ها را در فایل متنی تخلیه کنید
بیش پیچیده عملیات:
پیچیده
عملیات پیچیده با تعدادی پایگاه داده ورودی
دیگر عملیات:
فیلتر
فیلتر خواندن با تعداد بسیار کم k-mers
OPTIONS
جهانی پارامتر:
-t
تعداد کل رشته‌ها (پیش‌فرض: تعداد هسته‌های CPU)
-v
حالت کلامی را فعال کنید (برخی اطلاعات را نشان می دهد) (پیش فرض: نادرست)
-سپس
پنهان کردن درصد پیشرفت (پیش‌فرض: نادرست)
مثال
kmc_tools union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
از kmc_tools به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
