این دستور maqview است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
Maqview - نمایه ساز و بیننده تراز Maq
خلاصه
maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] در نقشه [CHR[:شروع[-پایان]] [...]
maqview [-c in.cns] در نقشه
شرح
Maqview مجموعه ای از برنامه ها است که دسترسی تصادفی سریع به فایل تراز را به دست می آورد
تولید شده توسط `Maq map'، و تراز را با یک رابط کاربری گرافیکی زیبا (کاربر گرافیکی) نمایش می دهد
رابط). در سرعت، حافظه و استفاده از دیسک بسیار کارآمد است. Maqview بر اساس
OpenGL و شناخته شده است که بر روی Mac OS X و Linux کار می کند. انتقال به ویندوز در اصل است
آسان است.
maqindex
maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] در نقشه [CHR[:شروع[-پایان]] [...]
-i فایل تراز را نمایه کنید
-v تراز را در منطقه مشخص شده در قالب 'maq mapview' چاپ کنید
-b تراز را در منطقه مشخص شده در قالب نقشه باینری تخلیه کنید
-c فایل فایل توافقی Maq را برای مشاهده همزمان در maqview فهرست کنید
برنامه maqindex یک فایل تراز maq را نمایه می کند در نقشه یا به سرعت تمام موارد خوانده شده را بازیابی می کند
یک یا چند منطقه یکی از -i, -v و -b باید استفاده شود. برای -v or -b، حداقل یکی
منطقه‌ای مانند «chrX»، «chrX:1000» یا «chrX:1,000-2,000» باید مشخص شود. مناطق متعدد
مجاز.
maqview
maqview [-c in.cns] در نقشه
-c فایل پرونده اجماع Maq
برنامه maqview تراز خواندن را در یک پنجره گرافیکی نمایش می دهد. چه زمانی in.cns is
مشخص شده است، دنباله بالا مرجع است، به دنبال دنباله اجماع Maq.
در غیر این صورت، اجماع اکثریت قانون محاسبه خواهد شد.
Maqview دو نما دارد: نمای توالی و نمای جعبه. در نمای توالی، دنباله ها را بخوانید
روی صفحه چاپ خواهد شد. پایه های تیره تر نشان دهنده کیفیت پایه پایین تر و پایه های قرمز است
تفاوت ها را در مقایسه با مرجع if نشان دهید in.cns مشخص شده است یا به
اجماع اکثریت حاکمیت اگر نه. در نمای جعبه، انواع مختلفی از نوکلئوتیدها وجود دارد
به صورت جعبه های رنگی با سبز برای A، فیروزه ای برای C، نارنجی برای G، قرمز برای T و تیره نشان داده شده است
خاکستری برای N. اشباع رنگ ها کیفیت پایه و خطوط ضخامت را نشان می دهد
از خواندن، کیفیت نقشه برداری ترازهای خوانده شده را نشان می دهد. بزرگنمایی/کوچک کردن فقط پشتیبانی می شود
در نمای جعبه در هر دو نما، نوار وضعیت در پایین پنجره مقداری را نشان می دهد
اطلاعات در مورد لمس کلید، و خواندن نام ها و کیفیت های پایه اشاره شده توسط ماوس.
پیمایش در تراز با اتصالات کلیدی مختلف انجام می شود.
· اتصالات کلیدی:
? نمایش راهنما
خروج
نمای توالی
نمای جعبه
p به دنباله مرجع قبلی بروید
n به دنباله مرجع بعدی بروید
r Refresh
حرکت به موقعیت نشان داده شده توسط
h / با یک پایه به سمت چپ حرکت کنید
l / با یک پایه به سمت راست حرکت کنید
k / یک خط به بالا حرکت کنید
j / یک خط به پایین حرکت کنید
> رفتن به خواندن بعدی
< انتقال به خواندن قبلی
g / به ابتدای مرجع فعلی بروید
G / به انتهای مرجع فعلی بروید
تو / یک صفحه به سمت چپ حرکت کنید
/ یک صفحه به سمت راست حرکت کنید
100 پایه حرکت کنید
با 1000 پایه حرکت کنید
+ یک نمای جدید اضافه کنید
- نمای فعلی را حذف کنید
روشن/خاموش کردن پیمایش خودکار سمت راست
^b پیمایش خودکار سمت چپ را روشن/خاموش کنید
+ بزرگنمایی
- کوچک نمایی
0 به مقیاس پیش فرض زوم کنید
q نمایش/پنهان کردن کیفیت های نقشه برداری را تغییر دهید
e کیفیت های نقشه برداری SE/PE را تغییر دهید
o یک فایل تراز جدید باز کنید
· یک عدد صحیح وارد کرده و سپس فشار دهید برای پریدن به موقعیت مورد نیاز
· یک عدد صحیح وارد کنید و سپس کلید دیگری را فشار دهید برای سرعت بخشیدن به اسکرول توسط
فاکتور مشخص شده
· کلیک چپ کرده و صلیب زرد را در مربع بکشید تا در امتداد دنباله حرکت کنید. درست
روی مرجع کلیک کنید تا یک ستون برجسته شود.
با استفاده از خدمات onworks.net از maqview آنلاین استفاده کنید
