ماهیچه - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

عضله - تراز چندگانه توالی پروتئین

خلاصه

عضله -که در ورودی پرونده (فستا) [بیرون تولید پرونده (پیش فرض فستا)] [-دیاگ] [-لاگ ورود به سیستم پرونده]
[ماکسیترها n] [حداکثر ساعت n] [-maxmb m] [-html] [-msf] [-clw] [-clwstrict]
[-log[a] ورود به سیستم فایل] [-ساکت] [-پایدار] [گروه] [-version]

شرح

این صفحه راهنما به اختصار مستندات عضله فرمان

عضله توالی های پروتئینی را تراز می کند و برتر و سریعتر از Clustal W در نظر گرفته می شود.

OPTIONS

-که در ورودی پرونده
مسیر فایل ورودی با فرمت FASTA

بیرون تولید پرونده
مسیر فایل خروجی، FASTA به صورت پیش فرض فرمت شده است

-دیاگ
پیدا کردن مورب (سریعتر برای دنباله های مشابه)

ماکسیترها n
حداکثر تعداد تکرار (عدد صحیح، پیش‌فرض 16)

حداکثر ساعت n
حداکثر زمان برای تکرار بر حسب ساعت (پیش‌فرض بدون محدودیت)

-maxmb m
حداکثر حافظه برای تخصیص بر حسب مگابایت (پیش‌فرض 80 درصد RAM)

-html
خروجی را با فرمت HTML بنویسید (فاستای پیش فرض)

-msf
خروجی را با فرمت MSF بنویسید (فاستای پیش فرض)

-clw
خروجی را با فرمت Clustal W (پیش‌فرض FASTA) بنویسید

-clwstrict
به صورت -clw، با هدر «CLUSTAL W (1.81)».

-log[a] ورود به سیستم فایل
ورود به فایل (افزودن اگر -loga، بازنویسی اگر -log)

-ساکت
پیام های پیشرفت را برای stderr ننویسید

-پایدار
دنباله های خروجی به ترتیب ورودی (پیش فرض گروهی است)

گروه
توالی ها را بر اساس شباهت گروه بندی کنید (این پیش فرض است)

-version
نمایش اطلاعات نسخه و خروج

با استفاده از خدمات onworks.net از عضله آنلاین استفاده کنید