newicktotxt - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

njplot - برنامه ترسیم درخت فیلوژنتیک برای زیست شناسان newicktops - draw phylogenetic
درختان به فایل پست اسکریپت

خلاصه

njplot [گزینه های] tree_file

تاپ های جدید [گزینه های] tree_file

newicktotxt [گزینه های] tree_file

شرح

این صفحه راهنما به اختصار مستندات njplot فرمان

La تاپ های جدید دستور دقیقاً همین کار را می کند اما نیازی به نمایشگر X11 ندارد. خروجی است
به یک فایل پست اسکریپت ارائه می شود.

La newicktotxt دستور دقیقاً همان کار را انجام می دهد تاپ های جدید اما خروجی ارائه می شود
در یک فایل متنی

این صفحه راهنما برای توزیع گنو/لینوکس دبیان بازنویسی شد زیرا نسخه اصلی بود
برنامه صفحه دستی ندارد.

njplot یک برنامه ترسیم درخت است که قادر به ترسیم هر درخت باینری یا چند شاخه ای است
در قالب درخت فیلوژنتیک استاندارد (به عنوان مثال، قالب استفاده شده توسط بسته PHYLIP).
NJplot مخصوصاً برای ریشه‌کردن درختان ریشه‌نشده به‌دست‌آمده از پرسیمونی مناسب است.
روش های درخت سازی فاصله یا حداکثر احتمال

هر گونه ریشه زایی درخت بدون ریشه را می توان به صورت تعاملی با استفاده از ماوس مشخص کرد. NJplot
همچنین امکان بزرگنمایی، تعویض شاخه، نمایش امتیازات بوت استرپ و ذخیره در آن را فراهم می کند
فرمت پست اسکریپت بنابراین NJplot می تواند به عنوان یک پسوند گرافیکی هر بسته استفاده شود
برنامه فیلوژنتیک که از قالب درخت استاندارد برای ذخیره درختان استفاده می کند (به عنوان مثال،
با اکثر چنین بسته هایی).

OPTIONS

فقط گزینه‌های زیر وجود دارد که فقط در یک شبیه‌ساز x-terminal کار می‌کنند، اما نه در آن
حالت کنسول:

-h کمک مختصر را چاپ می کند.

-و فایل درخت پست اسکریپت برای اندازه کاغذ US Letter آماده شده است.

-Psonly
بدون رابط پنجره، فقط فایل درختی PostScript را بنویسید.

-اندازه n
اندازه قلم n برای نام تاکسون استفاده می شود.

-pc n تعداد صفحات برای خروجی پست اسکریپت

-psize عرض ضخیم
اندازه صفحه پست اسکریپت به صورت WIDTHxHEIGHT بیان شده است.

-طول
اگر طول شاخه ها در فایل درختی ظاهر می شوند را نشان دهید.

-برو اگر مقادیر بوت استرپ در فایل درختی ظاهر شوند، نمایش داده شود.

-بدون عنوان
عنوان را در خروجی PostScript لحاظ نکنید.

با استفاده از خدمات onworks.net از newicktotxt به صورت آنلاین استفاده کنید