این پلاکنت فرمانی است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
پلاکنت - پروژه شبکه صورت فلکی پلاسمید
شرح
Placnet ابزار جدیدی برای تجزیه و تحلیل پلاسمید در پروژه های NGS است. Placnet برای کار بهینه شده است
با دنباله های Illumina اما با 454، Iontorrent یا هر کدام از موارد واقعی نیز کار می کند.
فن آوری های توالی
ورودی پلاکنت مجموعه ای از contigs و یک یا چند فایل SAM با نگاشت آن است
علیه contigs می خواند. Placnet مجموعه ای از فایل ها را به دست می آورد که به راحتی در Cytoscape باز می شوند
نرم افزار یا سایر ابزارهای شبکه
OPTIONS
قالب inputFile را بنویسید
پلکانت -تولید می کنند
فرآیند شبکه
پلکانت -f inputFile.txt -p پیشوند -l دقیقه
-f=s فایل ورودی برای تجزیه و تحلیل PLACNET.
-p=s نام پیشوند برای فایل های خروجی (پیش فرض 'placnet').
-l=s حداقل طول پیوسته تا فرآیند داربست (پیش‌فرض '200').
با استفاده از خدمات onworks.net از پلاکنت آنلاین استفاده کنید
