sim2gff - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

sim2gff - فایل سیم کارت را به رکوردهای با فرمت GFF تبدیل می کند

خلاصه

sim2gff [-frxyHh] sim_file > gff_file

شرح

این صفحه راهنما به اختصار مستندات sim2gff فرمان

sim2gff برنامه ای است که به زبان پرل نوشته شده است و فایل سیم کارت را به رکوردهای فرمت شده GFF تبدیل می کند
(برای استفاده با gff2aplot و gff2javaplot).

OPTIONS

-h، --کمک
نمایش خلاصه گزینه ها

-f خروجی در فایلی به نام نوشته می شود .gff.

-r ترتیب دنباله ها را با هم عوض کنید (Seq1 در محور y، Seq2 در محور x).

-x
نام گونه را برای species1 مشخص کنید (پیش‌فرض: "Seq1").

-y
نام گونه را برای species2 مشخص کنید (پیش‌فرض: "Seq2").

-H از هدرهای فایل fasta برای برچسب های گونه ها استفاده کنید.

خروج وضعیت

وضعیت خروج مانند perl زیر برگردانده می شود:

0 خطا

1 اتمام موفقیت آمیز

با استفاده از خدمات onworks.net از sim2gff آنلاین استفاده کنید