چرخش - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

spin - ابزار ویرایش و تجزیه و تحلیل DNA (بخشی از بسته staden)

خلاصه

چرخش [گزینه ها]

شرح

Spin یک برنامه تعاملی و گرافیکی برای تجزیه و تحلیل و مقایسه توالی است. آی تی
شامل توابعی برای جستجوی مکان‌های محدودیت، توالی‌ها/موتیف‌های اجماع و پروتئین است
مناطق کد کننده، می توانند ترکیب توالی را تجزیه و تحلیل کنند و DNA را به پروتئین ترجمه کنند.
همچنین دارای توابعی برای مکان یابی بخش های مشابه در داخل و بین است
دنباله ها و برای یافتن هم ترازی های سراسری و محلی بین جفت دنباله ها. برای کمک به
ارزیابی اهمیت آماری مقایسه هایی که برنامه می تواند جداول آن را محاسبه کند
فراوانی امتیازات مورد انتظار و مشاهده شده برای هر سطح امتیاز. اکثر توابع تحلیلی
که بر روی توالی‌های منفرد کار می‌کنند، نتایج گرافیکی خود را به «نقشه دنباله‌ای اسپین» اضافه می‌کنند.
که با توالی مورد تجزیه و تحلیل مرتبط است. (استثنا محدودیت است
جستجوی آنزیمی که پنجره جداگانه خود را تولید می کند.) اکثر توابع که جفت ها را با هم مقایسه می کنند
از توالی ها نتایج خود را به "نقشه مقایسه توالی SPIN" اضافه می کنند. دنباله چرخش
نمودار و نمودار مقایسه توالی چرخش هر کدام دارای پنجره های نمایش توالی مرتبط هستند:
نمایشگر توالی و نمایشگر مقایسه توالی. این اجازه می دهد تا متن از
دنباله هایی برای مشاهده و استفاده از مکان نما برای نشان دادن موقعیت های مربوطه در
نمایشگرهای گرافیکی نمودارهای گرافیکی را می توان بزرگنمایی کرد، و مکان نماها یا خطوط متقاطع را می توان زوم کرد
برای تعیین موقعیت نتایج فردی استفاده می شود. توطئه ها را می توان روی هم قرار داد.

OPTIONS

-نقشه رنگی: نقشه رنگی برای پنجره اصلی

-نمایش دادن:
نمایش برای استفاده

-هندسه: هندسه اولیه برای پنجره

-سیب زمینی شیرین:
نام مورد استفاده برای برنامه

-sync: از حالت همزمان برای سرور نمایش استفاده کنید

-دیداری:
تصویری برای پنجره اصلی

-استفاده کنید: شناسه پنجره ای که برنامه در آن جاسازی می شود

--: همه آرگومان های باقی مانده را به اسکریپت منتقل کنید

با استفاده از خدمات onworks.net از چرخش آنلاین استفاده کنید