این برنامه لینوکس به نام MIRA است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان mira-4.0.2.tar.bz2 دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام MIRA را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
MIRA
DESCRIPTION:
MIRA - مونتاژ کننده توالی و نقشه برداری توالی برای کل ژنوم تفنگ ساچمه ای و داده های توالی یابی EST / RNASeq. می توانید از داده های Sanger، 454، Illumina و IonTorrent استفاده کنید. PacBio: داده های CCS و خطای تصحیح شده قابل استفاده است، هنوز اصلاح نشده است.
امکانات
- به مجموعه‌های ترکیبی داده‌های Sanger، 454، Solexa، IonTorrent و PacBio (CCS و ecCLR) اجازه می‌دهد.
- می تواند از داده های جفت شده و/یا جفت نشده استفاده کند
- پشتیبانی از داده های جانبی در قالب TRACEINFO (از NCBI)
- مکان‌های مورد علاقه را با برچسب‌ها علامت‌گذاری می‌کند تا بتوان آنها را به سرعت در برنامه‌های تکمیلی پیدا کرد
- دارای خط لوله تجزیه و تحلیل SNP برای توالی یابی داده های ویروس ها و پروکاریونت ها
مخاطبان
کاربران نهایی پیشرفته، علم/تحقیق
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/mira-assembler/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.