این برنامه لینوکس به نام skewer است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان benchmark1-arabidopsis.thaliana-scripts.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام skewer را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
سیخ
DESCRIPTION:
این برنامه یک الگوریتم برنامه نویسی پویا جدید را پیاده سازی می کند که به وظیفه برش آداپتور اختصاص داده شده است و به طور ویژه برای پردازش توالی های انتهای جفت ایلومینا طراحی شده است.
امکانات
- تشخیص و حذف توالی آداپتور
- درج و حذف در تطبیق الگو مجاز است
- هدفمند در Single End، Paired End (PE) و Long Mate Pair (LMP) خوانده می شود
- Demultiplexing از اجراهای توالی بارکد
- پشتیبانی چند رشته ای
- پیرایش بر اساس نمرات کیفیت phred
- کاراکترهای IUPAC برای بارکدها و آداپتورها
- پشتیبانی از ورودی و خروجی فشرده
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/skewer/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.