این برنامه لینوکس با نام RNAseqR است که آخرین نسخه آن را می توان با نام RNAseqR_1.1.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام RNAseqR را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
RNAseqR
شرح
RNAseqR برای تجزیه و تحلیل بیان داده های RNA-seq طراحی شده است و برای تجزیه و تحلیل کتابخانه های متعدد و تکرار نشده مناسب است. این یک برنامه کدگذاری شده C++ است که در حال حاضر برای سیستم های لینوکس کامپایل شده است.
با رابط‌های رابط کاربری گرافیکی و خط فرمان، می‌تواند تبدیل‌های log، PPM، و/یا RPKM (در صورت ارائه طول) و همچنین تحلیل آماری برای بیان دیفرانسیل، با استفاده از تابع توزیع تجمعی دوجمله‌ای منفی (CDF) یا آمار آزمون R انجام دهد. برای تجزیه و تحلیل EST توسط Stekel، و همکاران معرفی شده است.
خروجی امکان تصمیم گیری بر اساس احتمالات CDF، مقادیر بالای R یا مقایسه مقادیر R با داده های تصادفی را فراهم می کند. مقایسه ها معیار باورپذیری Stekel و همکاران است، یا مشاهده شده در مقابل R مورد انتظار در یک بیان میانگین معین. تصادفی‌سازی از طریق پواسون یا توزیع‌های دوجمله‌ای منفی یا به هم زدن ستون انجام می‌شود.
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
