این برنامه لینوکس با نام SUPERmerge است که آخرین نسخه آن را می توان با نام SUPERmerge.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام SUPERmerge را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
SUPER ادغام
شرح
SUPERmerge یک الگوریتم تجزیه و تحلیل و حاشیه نویسی انباشته خواندن چیپ-seq برای بررسی فایل های تراز (BAM) مجموعه داده های چیپ-seq اصلاح هیستون منتشر با دامنه های کروماتین گسترده در سطح وضوح جفت پایه تک است. SUPERmerge به تنظیم انعطاف پذیری انواع پارامترهای انباشته خوانده شده اجازه می دهد، در نتیجه نشان می دهد که جزایر خوانده شده چگونه در مناطقی از پوشش ژنوم جمع می شوند و چه ویژگی های حاشیه نویسی را در تکثیرهای بیولوژیکی نگاشت می کنند. SUPERmerge به ویژه برای بررسی آزمایش‌های ChiP-seq با اندازه نمونه کم که در آن تغییرات هیستون اپی ژنتیکی (مانند H3K9me1، H3K27me3) منجر به پیک‌های ذاتاً گسترده با طیف گسترده‌ای از غنی‌سازی سیگنال می‌شود که مکان‌های ژنومی متوالی متعدد و ویژگی‌های مشروح را در بر می‌گیرد، مفید است.
امکانات
- ChiP-Seq
- اپی ژنتیک
- بیوانفورماتیک
- زیست شناسی محاسباتی
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/supermerge/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
