این برنامه ویندوز با نام AutoDockParser است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان AutodockParser.exe دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام AutoDockParser را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
AutoDockParser
Ad
شرح
AutoDock Suit یکی از محبوب ترین نرم افزارها برای انجام Docking Molecular و Virtual Screening است. این لباس دو برنامه AutoDock و AutoDock Vina را ارائه می دهد. AutoDock خروجی خود را به صورت Docking Log Files (فایل های DLG) ارائه می دهد، در حالی که دومی با فرمت pdbqt خروجی می دهد.
پس پردازش این نتایج مدت‌هاست که به صورت دستی باقی مانده است و از این رو پروتکل‌ها و گردش‌های کاری مختلفی طراحی می‌شوند که مختص کاربر هستند. پردازش دستی این نتایج برای تجزیه و تحلیل متقابل بعدی یک کار وقت گیر و ظاهرا پیش پا افتاده باقی مانده است. پردازش دستی شامل وابستگی به نرم افزارهای خارجی مختلف است.
AutoDock Parser پس پردازش خودکار نتایج اتصال به دست آمده از AutoDock Suit را ارائه می دهد. AutoDock Parser یک ابزار کاربرپسند است که با هدف به حداقل رساندن تلاش ها در پس پردازش نتایج Docking انجام می شود. این کاربر را قادر می سازد تا مجتمع های پروتئین لیگاند را از فایل های ورودی DLG/PDBQT در یک مرحله ایجاد کند.
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/autodockparser/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از طریق یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
