این برنامه ویندوز با نام FastQC است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان v0.12.1sourcecode.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام FastQC را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
FastQC
شرح
FastQC یک ابزار تجزیه و تحلیل کنترل کیفیت است که برای شناسایی مشکلات بالقوه در مجموعه داده های توالی توان عملیاتی بالا طراحی شده است. هدف آن ارائه روشی ساده برای بررسی کیفیت داده‌های توالی خام حاصل از خطوط لوله توالی‌یابی با توان عملیاتی بالا است. این کار را با اجرای مجموعه‌ای از تحلیل‌های مدولار بر روی یک یا چند فایل توالی خام با فرمت fastq یا bam انجام می‌دهد. سپس گزارشی را تهیه می‌کند که نتایج را خلاصه می‌کند، و مناطقی را که کتابخانه ممکن است غیرعادی به نظر برسد برجسته می‌کند. سپس شما را به جایی هدایت می کند که داده های شما ممکن است مشکل داشته باشد و به شما اجازه می دهد قبل از انجام هر گونه تجزیه و تحلیل بیشتر، اقدامات لازم را برای تصحیح آن انجام دهید.
FastQC به هیچ نوع خاصی از تکنیک توالی یابی گره خورده نیست، بنابراین می توان از آن برای مشاهده کتابخانه های انواع آزمایشات مختلف (Genomic Sequencing، ChIP-Seq، RNA-Seq، BS-Seq و غیره) استفاده کرد.
امکانات
- داده ها را از فایل های BAM، SAM یا FastQ وارد می کند
- یک نمای کلی سریع ارائه می دهد که مناطق مشکل بالقوه را برجسته می کند
- نمودارها و جداول خلاصه برای ارزیابی سریع داده ها
- نتایج را به HTML صادر کنید
- می توان از آفلاین استفاده کرد
زبان برنامه نویسی
جاوه
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
