این برنامه ویندوز با نام Hadoop-BAM است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان hadoop-bam-7.1.0.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام Hadoop-BAM را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
Hadoop-BAM
Ad
شرح
Hadoop-BAM یک کتابخانه جاوا برای دستکاری فایل ها در قالب های رایج بیوانفورماتیک با استفاده از چارچوب Hadoop MapReduce با Picard SAM JDK و ابزارهای خط فرمان مشابه SAMtools است.
فرمت های فایلی که در حال حاضر پشتیبانی می شوند عبارتند از BAM، SAM، FASTQ، FASTA، QSEQ، BCF و VCF.
برای توصیف بلندتر Hadoop-BAM، به مقاله "Hadoop-BAM: دستکاری مستقیم داده های توالی نسل بعدی در ابر" در Bioinformatics جلد 28 شماره 6 صفحات 876-877، در دسترس آنلاین در: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts054
توجه داشته باشید که بخش کتابخانه Hadoop-BAM عمدتا برای توسعه دهندگان با تجربه در استفاده از Hadoop است. ابزارهای خط فرمان Hadoop-BAM باید برای همه کاربران قابل درک باشد، اما دامنه آنها محدود است.
پروژه SeqPig را برای یک رابط سطح بالاتر با فرمت های فایل پشتیبانی شده توسط Hadoop-BAM ببینید: http://seqpig.sourceforge.net
Seal برای ابزارهای تراز خواندن مبتنی بر Hadoop، Seal را ببینید: http://biodoop-seal.sourceforge.net
مخاطبان
توسعه دهندگان
زبان برنامه نویسی
جاوه
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
