این برنامه ویندوز به نام iCAS - یک سیستم جمع آوری کلون Illumina برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام icas_v062.tar.bz2 دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
دانلود و اجرای آنلاین این برنامه به نام iCAS - سیستم جمع آوری کلون Illumina برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
iCAS - یک سیستم مونتاژ کلون Illumina برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین
Ad
شرح
توالی‌یابی کلون به کلون، به‌عنوان وسیله‌ای برای دستیابی به مجموعه‌های با کیفیت بالا برای ژنوم‌های بزرگ و پیچیده، همچنان در عصر توالی‌یابی با توان عملیاتی بالا، اهمیت زیادی دارد. با این حال، مجموعه‌های به‌دست‌آمده با استفاده از مونتاژکننده‌های کل ژنوم فعلی اغلب تکه‌تکه هستند و گاهی اوقات به دلیل ویژگی‌های داده‌های مختلف معرفی‌شده توسط توالی‌یابی چندگانه، مشکلاتی در مورد کامل بودن ژنوم دارند.با iCAS، فرآیند فیلتر کردن داده ها بر اساس یک الگوریتم فرکانس کیلومتر جدید است که منجر به خواندن تقریباً کامل قبل از مونتاژ می شود. Contig ها با استفاده از الگوریتم های مونتاژ مختلف تولید می شوند و سپس برای دستیابی به تداوم طولانی تر با هم ادغام می شوند. هم‌تراز کردن مجدد همه خوانده‌ها با پیش‌نویس‌های پیش‌نویس و کالیبره‌سازی مجدد هر پایه توالی، به اجماع نهایی دست می‌یابد. با استفاده از کلون های نهایی برای QC، خط لوله می تواند مجموعه هایی با پوشش کلون 99.7٪ و کیفیت پایه توافقی Q39 به دست آورد.
توسعه یافته در موسسه Wellcome Trust Sanger.
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پرل، سی
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/icas/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
