این برنامه ویندوز به نام PBSuite برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام PBSuite_15.8.24.tgz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام PBSuite را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
PBSuite برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین
شرح
این در حال حاضر میزبان دو پروژه است که توسط Adam English ایجاد و نگهداری می شود.PBJelly - ابزار ارتقاء ژنوم.
PBHoney - ابزار کشف تغییرات ساختاری
هر دو در کد PBSuite موجود در دانلودها قرار دارند.
----- PBJelly -----
مقاله را بخوانید
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly یک خط لوله بسیار خودکار است که خواندن های توالی طولانی (مانند خواندن های PacBio RS یا خواندن طولانی 454 در قالب fasta) را با مجموعه های پیش نویس با اطمینان بالا تراز می کند. PBJelly تا آنجا که ممکن است شکاف های ثبت شده را پر یا کاهش می دهد تا ژنوم های پیش نویس ارتقا یافته را تولید کند.
----- PBHoney -----
مقاله را بخوانید
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney پیاده‌سازی دو رویکرد شناسایی متغیر است که برای بهره‌برداری از نقشه‌پذیری بالای خواندن طولانی (یعنی بیش از 10,000 جفت باز) طراحی شده است. PBHoney هم ناهماهنگی درون خواندنی و هم دم های نرم بریده شده از خواندن های طولانی را برای شناسایی انواع ساختاری در نظر می گیرد.
امکانات
- مونتاژ ژنوم
- ارتقاء ژنوم
- تنوع ساختاری
- ارزیابی مجمع
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پــایتــون
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
