Il s'agit de la commande afetch qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS.
PROGRAMME:
Nom
afetch - récupère un alignement à partir d'une base de données d'alignement
SYNOPSIS
aller chercher [choix] alignementdb clé
aller chercher --indice alignementdb
DESCRIPTION
aller chercher récupère l'alignement nommé clé à partir d'une base de données d'alignement dans un fichier alignementdb.
alignementdb est un fichier « alignement multiple multiple » à Stockholm (par exemple, Pfam natif)
le format.
clé est soit le nom (ID) de l'alignement, soit son numéro d'accession (AC).
VOTRE alignementdb fichier doit d'abord être indexé SSI avec aller chercher --indice pour efficace
récupération. Un index SSI n'est pas requis, mais la récupération de l'alignement sans un peut être
douloureusement lent.
OPTIONS
-h Imprimer une brève aide ; inclut le numéro de version et un résumé de toutes les options, y compris
options d'experts.
EXPERT OPTIONS
--indice
Au lieu de récupérer un clé, la commande spéciale aller chercher --indice alignementdb
produit un index SSI des noms et accessions des alignements dans le fichier
alignementdb. Cela devrait être exécuté une fois sur le alignementdb dossier pour le préparer pour tous
futur afetch.
Utilisez afetch en ligne à l'aide des services onworks.net
