Il s'agit de la commande ali2gff qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
ali2gff - Module pour traduire un fichier de sortie MUMmer en sortie au format gff.
SYNOPSIS
ali2gff [-r] [-t <.|0|1|2>] [-x ] [-y ] [-H] [-f] [-h]
OPTIONS
-h, --Aidez-moi
Afficher le résumé des options.
-r Interchangez l'ordre des séquences (séquence 1 sur l'axe des y, séquence 2 sur l'axe des x).
-t <.|0|1|2>
Mettez l'étiquette 'frame' dans la sortie gff.
-x
Spécifiez le nom de l'espèce pour l'espèce1 (par défaut : « Seq1 »).
-y
Spécifiez le nom de l'espèce pour l'espèce2 (par défaut : « Seq2 »).
-i Ignorer les identités de séquence complète.
-f Écrire la sortie dans un fichier.
Utilisez ali2gff en ligne en utilisant les services onworks.net
