Il s'agit de la commande bp_local_taxonomydb_queryp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_local_taxonomydb_query - interroge une TaxonomyDB locale pour une espèce ou un taxonide
DESCRIPTION
Ce script fournit un exemple d'implémentation d'accès à une base de données taxonomique locale
implémenté avec Berkeley DB (le module DB_File est nécessaire).
Usage:
bp_local_taxonomydb_query.PLS : [-v] --nodes nodes.dmp --names names.dmp "Genus1 species1" "Genus2 species2"
Fournir les fichiers nodes.dmp et names.dmp à partir du vidage de taxonomie NCBI (voir
Bio::DB::Taxonomy::flatfile pour plus d'informations) n'est nécessaire que lors de la première exécution.
Cela créera les index locaux et peut prendre un certain temps. Cependant, une fois créé,
ces index permettront un accès rapide pour les espèces à l'identifiant du taxon OU l'identifiant du taxon au nom de l'espèce
recherches.
Utilisez bp_local_taxonomydb_queryp en ligne à l'aide des services onworks.net
