Il s'agit de la commande cmtk-interleaved_bad_slices qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
interleaved_bad_slices - Trouve les mauvaises tranches dans une série temporelle d'images entrelacées (par exemple, un
série d'IRMf au repos).
SYNOPSIS
entrelacé_bad_slices CheminsImage
DESCRIPTION
Cet outil lit une série temporelle d'images 3D et détecte les valeurs aberrantes.
OPTIONS
Global Boîte à outils Options (celles-ci are a partagé la publication de by tous CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.
--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.
- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.
--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.
--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.
--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.
--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.
--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).
--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).
Entrée Options
--orientation-tranche
Définir l'orientation des tranches des images de diffusion. Valeurs prises en charge : « axial »,
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", où la valeur par défaut est "axial",
ou utilisez l'un des éléments suivants :
--axial
Tranches axiales [Ce is le défaut]
--sagittal
Tranches sagittales
--coronaire
Tranches coronales
--tranche-x
L'axe de coordonnées X est la direction de la tranche
--tranche-y
L'axe de coordonnées Y est la direction de la tranche
--slice-z
L'axe de coordonnées Z est la direction de la tranche [Ce is le défaut]
Mal Tranche Détection
--métrique
Métrique de similarité image à image pour comparer des tranches voisines. Valeurs prises en charge :
"ncc", "rms", où la valeur par défaut est "ncc", ou utilisez l'un des éléments suivants :
--ncc
Corrélation croisée normalisée. [Ce is le défaut]
--rms
Racine des différences quadratiques moyennes.
--stdev-seuil
Seuil pour l'identification de la mauvaise tranche en unités d'écarts types d'intensité sur
toutes les tranches correspondantes des images de diffusion restantes. [Défaut: 3]
Sortie Options
--mauvaises tranches-battage
Nombre minimum de tranches incorrectes détectées avant de signaler un volume (uniquement le nombre de
les mauvaises tranches détectées sont signalées dans ce cas, plutôt que chaque tranche séparément).
[Défaut: 0]
AUTEURS
Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko
Utilisez cmtk-interleaved_bad_slices en ligne à l'aide des services onworks.net
