Il s'agit de la commande dbgete qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
dbget - Récupérer les entrées de base de données pour une base de données nommée, le type de données et l'identifiant de données
SYNOPSIS
dbget -base de données un magnifique -Type de données un magnifique -identifiant un magnifique [-fichier de sortie fichier de sortie]
-répertoire extérieur extérieur
dbget -Aide
DESCRIPTION
dbget est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open Software
Suite"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Utils:Misc".
OPTIONS
Entrée
-base de données un magnifique
C'est le nom d'une base de données du catalogue des bases de données publiques de l'EMBOSS
fichier de données DRCAT.dat. Si vous n'êtes pas sûr des bases de données disponibles, utilisez dbfind. Si tu
avez un nom de base de données mais n'êtes pas sûr qu'il soit valide, utilisez isdbname.
-Type de données un magnifique
C'est le nom d'un type de données récupérable du catalogue des bases de données publiques dans
le fichier de données EMBOSS DRCAT.dat. Les noms sont des termes de la branche « données » de l'EDAM
ontologie, http://edamontology.sourceforge.net/. Si vous n'êtes pas sûr de la disponibilité
types de données récupérables pour une base de données donnée, utilisez dbtellquery. Si vous avez un type de données
name mais n'êtes pas sûr qu'il soit valide, utilisez isdbdata.
-identifiant un magnifique
Il s'agit d'un identifiant de données (par exemple un numéro d'accession de séquence) qui est utilisé pour spécifier
les données (de type 'datatype') à récupérer. Si vous n'êtes pas sûr du ou des identifiants de données
qui sont utilisés pour une requête donnée (base de données/type de données) utilisent dbtellquery. Les types de données
identifiant sont répertoriés sous la branche 'Data identifier' de l'ontologie EDAM
(http://edamontology.sourceforge.net/). Pour des exemples de valeurs, voir le catalogue de
bases de données publiques dans le fichier de données EMBOSS DRCAT.dat. Si vous avez un identifiant de données mais
n'êtes pas sûr de son type, utilisez idtell.
Requis
Supplémentaire
Avancé
Sortie
-fichier de sortie fichier de sortie
Valeur par défaut : stdout
-répertoire extérieur extérieur
Valeur par défaut: .
Utiliser dbgete en ligne en utilisant les services onworks.net
