Il s'agit de la commande ecofind qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
ecofind - recherche d'identifiants taxonomiques, de rang et de taxonomie pour une expression régulière donnée
motifs
DESCRIPTION
ecoPCR est un logiciel PCR électronique développé par LECA et Helix-Project. Cela aide à
estimer la qualité des amorces de codes-barres.
Ce programme appartient au package exoPCR.
SYNOPSIS
ecofin [choix]
OPTIONS
-a : [A]ll activer la recherche sur tous les noms alternatifs et pas seulement les noms scientifiques.
-d : [D]base de données contenant la taxonomie.
Pour correspondre au format attendu, la base de données doit d'abord être formatée par le
programme ecoPCRFormat.py situé dans le répertoire tools. Écrire le radical de la base de données
sans aucune prolongation.
-h : [A]elp - imprimer aider
-l : [L]ist tous les classements taxonomiques disponibles pour -r option
-P : [P]ath : ajoute une colonne contenant le chemin complet pour chaque taxon affiché
-p : [P]arents : la spécification de cette option affiche toutes les informations de l'arbre parental pour le
donné taxid.
-r : [R]limiter au rang taxonomique donné
-s : [S]ons : la spécification de cette option affiche toutes les informations du sous-arbre pour le
taxi.
-P : Afficher taxonomique [P]ath en tant que colonne supplémentaire dans la sortie
arguments:
modèle de nom contenant des expressions régulières
Utilisez ecofind en ligne en utilisant les services onworks.net
