Il s'agit de la commande fastqselect qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
sélection rapide - Sélectionner rapide séquences in a filet
DESCRIPTION
Ce script sélectionne les séquences fastq dans un fichier en fonction des noms donnés dans un fichier de noms.
Étant donné un fichier FASTQ (et éventuellement un fichier de qualité FASTQ) et un fichier avec des noms de lectures,
sélectionner les séquences depuis l'entrée FASTQ (et le fichier qualité) et les écrire dans une sortie
FASTQ.
Si le fichier de qualité fastq est présent (même nom de base, mais avec .qual ajouté), alors également
sélectionne les séquences à partir de là.
Veuillez consulter la documentation ci-dessous pour des informations plus détaillées.
SYNOPSIS
sélection rapide
OPTIONS
-dans le fichier
name nom de fichier contenant toutes les séquences fastq
-patate douce name nom de fichier contenant tous les noms de séquences à sélectionner
-fichier de sortie prénom
nom de fichier où écrire les séquences sélectionnées
Utilisez fastqselect en ligne en utilisant les services onworks.net
