Il s'agit de la commande last-dotplot qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
last-dotplot - faire un dotplot, alias Oxford Grid, des alignements au format tabulaire LAST
SYNOPSIS
dernier-dotplot --Aidez-moi
dernier-dotplot [Options] maf-or-tab-alignements dotplot.png
dernier-dotplot [Options] maf-or-tab-alignements dotplot.gif
DESCRIPTION
Dessinez un dotplot d'alignements de séquences par paires au format MAF ou tabulaire.
OPTIONS
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-1 SCHÉMA, --séq1=RECONNAISSANCE
quelles séquences montrer du 1er génome
-2 SCHÉMA, --séq2=RECONNAISSANCE
quelles séquences montrer du 2e génome
-x LARGEUR, --largeur=LARGEUR
largeur maximale en pixels (par défaut : 1000)
-y LA TAILLE, --la taille=HAUTEUR
hauteur maximale en pixels (par défaut : 1000)
-f DÉPOSER, --fichierpolice=DOSSIER
Fichier de police TrueType ou OpenType
-s TAILLE, --taille de police=TAILLE
Taille de police TrueType ou OpenType (par défaut : 11)
-c COULEUR, --forwardcolor=COULEUR
couleur pour les alignements vers l'avant (par défaut : rouge)
-r COULEUR, --couleur inversée=COULEUR
couleur pour les alignements inversés (par défaut : bleu)
Options d'espacement non séquencé :
--écart1=DOSSIER
lire les lacunes non séquencées du génome1 à partir du fichier agp ou gap
--écart2=DOSSIER
lire les lacunes non séquencées du génome2 à partir du fichier agp ou gap
--couleur pontée=COULEUR
couleur pour les espaces comblés (par défaut : jaune)
--couleur sans pont=COULEUR
couleur pour les espaces non pontés (par défaut : rose)
Utilisez last-dotplot en ligne en utilisant les services onworks.net