Il s'agit de la commande propka qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
propka - Fichiers PDB de protonate basés sur pKa
SYNOPSIS
Propka PROPKATMP1
DESCRIPTION
Propka automatise la protonation (positionnement des ions hydrogène) vers une structure en PDB
format pour une valeur pKa donnée. Le fichier à utiliser doit être nommé PROPKATMP1 dans le
répertoire où propka est exécuté.
Propka générera deux fichiers de sortie nommés PROPKATMP2 et PROPKATMP3. PROPKATMP2
contient la structure résultante au format PDB. PROPKATMP3 contient un résumé des
Propka fonctionner.
CITANT PROPKA
Veuillez reconnaître votre utilisation de Propka en citant :
Hui Li, Andrew D. Robertson et Jan H. Jensen : prédiction empirique très rapide et
Interprétation des valeurs de pKa des protéines, Protéines, 2005, 61, 704-721.
WEB MAINTENANCE
PropKa peut être utilisé via une interface web à http://propka.ki.ku.dk/.
Utilisez propka en ligne en utilisant les services onworks.net
