Il s'agit de la commande TMalign qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
TMalign - alignement de la structure des protéines
SYNOPSIS
TMaligne structure.pdbcible.pdb[Options]
DESCRIPTION
TMalign effectue un alignement structurel des protéines. L'alignement est noté par le TM-
algorithme de score.
OPTIONS
Lorsqu'il est démarré sans options, un résumé des commandes est donné. Avec deux structures protéiques
présenté comme arguments, le score TM utilise la longueur de la deuxième protéine à
normalisé. L'alignement structurel final est invariant pour l'une des options ci-dessous.
-L nombre normalise le score TM d'une longueur assignée (en aa)
-a normalise le score TM par la longueur moyenne des deux structures
-b normalise le score TM par la longueur de la plus courte des deux structures
-c normalise le score TM par la longueur de la plus longue des deux structures
-o nom de fichier Exécutez TM-align et affichez la superposition dans 'filename.sup' et
'nom_fichier.sup_all'. Les fichiers de sortie servent de scripts au programme rasmol. À
voir les structures superposées des régions alignées appeler
'rasmol -script TM.sup' Pour visualiser les structures superposées de toutes les régions
'rasmol -script TM.sup_all'.
Utilisez TMalign en ligne en utilisant les services onworks.net
