Il s'agit de l'application Linux nommée Athus dont la dernière version peut être téléchargée sous Athus-1.8.9.2-sources.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Athus avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Athus
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DESCRIPTION
Ce projet vous aide à effectuer des analyses génétiques de population en prenant en charge les étapes de manipulation de données laides, ennuyeuses et sujettes aux erreurs.
À partir des formats d'entrée bien spécifiés VCF, BED et FASTA et d'un fichier de configuration unique décrivant les données (par exemple à partir de tableaux SNP ou de séquençage) ainsi que le filtrage, on peut créer des formats POPGEN standard comme Eigenstrat, PEDMAP (PLINK), Treemix ...
De plus, il existe plusieurs utilitaires pour
* génération de VCF à partir des données SNPArray (NCBI - GEO, fichiers d'appel Illumina)
* travailler avec des cartes génétiques ...
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal, ligne de commande
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/bioathus/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
