Il s'agit de l'application Linux nommée BADASS dont la dernière version peut être téléchargée en tant que badass.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée BADASS avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
BADASS
Ad
DESCRIPTION
BADASS est un logiciel doté d'une interface graphique conviviale appliquée à la recherche et à l'analyse de la diversité des bactériocines dans les données de séquençage shotgun du métagénome entier. La recherche de séquences de bactériocines est effectuée avec des outils tels que BLAST ou DIAMOND en utilisant la base de données BAGEL4 comme référence. Les séquences putatives de bactériocine identifiées sont utilisées pour déterminer l'abondance et la richesse des trois classes décrites jusqu'à présent. L'abondance est calculée en comparant les lectures identifiées comme bactériocines aux lectures identifiées comme gène d'ARNr 16S en utilisant la base de données SILVA comme référence. L'utilisateur peut modifier les principaux paramètres de l'analyse dans l'interface graphique.
Caractéristiques
- La version badass_v1.2 offre la possibilité d'exécuter MAC et Windows. En plus de Linux.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/badass/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
