Il s'agit de l'application Linux nommée cnvHiTSeq dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom cnvHiTSeq-0.1.2.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée cnvHiTSeq avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
cnvHiTSeq
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DESCRIPTION
cnvHiTSeq est un ensemble d'outils de ligne de commande basés sur Java pour détecter les variantes de nombre de copies (CNV) à l'aide de données de séquençage de nouvelle génération. cnvHiTSeq utilise des fichiers BAM standard en entrée.
Audience
Science/Recherche, Développeurs
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/cnvhitseq/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.