Il s'agit de l'application Linux nommée CRISPR-Offinder à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée en tant que CRISPR-offinder-1.0.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CRISPR-Offinder pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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CRISPR-Offinder pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Résumé : Concevoir de petits ARN guides CRISPR (sgRNA) efficaces et spécifiques est l'une des clés d'une application réussie de la technologie CRISPR. Il est important de noter que de plus en plus de nouvelles endonucléases guidées par l'ARN avec différents motifs adjacents aux protoespaceurs (PAM) ont été découvertes. Par conséquent, il existe un besoin urgent de développer un outil polyvalent pour concevoir des ARNsg afin de satisfaire les exigences des différentes endonucléases d'ADN guidées par l'ARN. À cette fin, un programme de conception d'ARNsg flexible nommé « CRISPR-offinder » a été développé. La caractéristique la plus importante de ce nouveau programme est qu'il prend en charge tous les types PAM connus, ainsi que le PAM défini par le client. En outre, CRISPR-offinder peut trouver et classer les sgRNA candidats dans le génome par numéro de sites hors cible, et peut également être utilisé pour concevoir des ARNg simples ou appariés. CRISPR-offinder est disponible gratuitement sous forme de programme en ligne de commande ou accessible via notre site Web.Disponibilité : CRISPR-offinder est disponible gratuitement sur http://crispr-offinder.com/ or http://crispr.igenetech.com/.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/crispr-offinder/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
