Il s'agit de l'application Linux nommée DACO-algorithm dont la dernière version peut être téléchargée sous JDACO_1.03.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez gratuitement en ligne cette application nommée algorithme DACO avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN:
Algorithme DACO
DESCRIPTION:
L'expression des gènes eucaryotes est contrôlée par des circuits de logique moléculaire qui combinent des signaux régulateurs de nombreux facteurs différents. La complexation des facteurs de transcription et d'autres protéines régulatrices est un mécanisme prédominant et hautement conservé d'intégration du signal dans les voies régulatrices critiques et permet d'inférer des gènes contrôlés ainsi que le mécanisme régulateur exercé.
Nous avons développé DACO (optimisation de la cohésion consciente du domaine), un nouvel algorithme qui combine les réseaux d'interaction protéine-protéine et les réseaux d'interaction domaine-domaine avec la cohésion métrique de qualité cluster. La métrique est localement maximisée au niveau holistique des interactions protéiques tandis que des contraintes de connectivité sophistiquées au niveau du domaine sont utilisées pour tenir compte de la nature exclusive et donc intrinsèquement combinatoire des interactions au sein de ces assemblages.
La publication originale se trouve sur http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415 .
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal
Langage de programmation
Python, Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/dacoalgorithm/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.