Il s'agit de l'application Linux nommée detectMITE dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom detectMITE.20170425.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée detectMITE avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
détecterMITE
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DESCRIPTION
detectMITE - un outil basé sur MATLAB pour détecter les éléments transposables répétés inversés miniatures (MITE) dans les génomes.
[1] Qui sommes-nous ?
Veuillez visiter le site Web : http://bioinfolab.miamioh.edu
[2] Comment citer detectMITE ?
Ye C, Ji G, Liang C (2016) detectMITE : une nouvelle approche pour détecter des éléments transposables répétés inversés miniatures dans les génomes. Sci. Rép. 6, 19688. http://www.nature.com/articles/srep19688
Ye C, Ji G, Li L, Liang C (2014) detectIR : un nouveau programme pour détecter les répétitions inversées parfaites et imparfaites à l'aide de nombres complexes et de calculs vectoriels. PLoS ONE 9(11) : e113349. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0113349
[3] mode d'emploi detectMITE
Veuillez visiter la page Wiki de ce site Web.
[4] detectMITE Q&R
Pour les questions et réponses, veuillez visiter la page Blog de ce site Web.
[5] Historique des mises à jour
Pour voir l'historique des mises à jour, accédez à https://sourceforge.net/p/detectmite/wiki/UpdateHistory/
Caractéristiques
- Basé sur MATLAB
- Calcul vectoriel
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
MATLAB
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/detectmite/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
